La chiesa di San Pietro era uno dei principali edifici religiosi di Gubbio e, anche se non si hanno notizie certe, si presume che risalga almeno al 1000. Appartenne ai Benedettini cassinesi e poi agli olivetani che trasformarono la chiesa e l’abbazia in stile rinascimentale. La facciata della chiesa presenta le tracce di diversi interventi. L’interno è a navata unica e conserva la conformazione conferita nel Cinquecento. Fra le opere d’arte conservate spicca in controfacciata il maestoso organo maggiore, opera di V. Beltrami, con ornamento di Antonio e Giambattista Maffei (1580-1585). Notevoli sono anche i dipinti di Virgilio Nucci, Francesco Allegrini, Raffaelino del Colle, Rutilio Manetti e Agostino Tofanelli nelle cappelle laterali.